Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg2O55111 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms