Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6bO54951 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema6bO54951 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms