Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh16O54909 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms