Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EdaO54693 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EdaO54693 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EdaO54693 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EdaO54693 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EdaO54693 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EdaO54693 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EdaO54693 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EdaO54693 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms