Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms