Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf9O35739 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Klf9O35739 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Klf9O35739 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Klf9O35739 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Klf9O35739 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Klf9O35739 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Klf9O35739 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf9O35739 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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