Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn1mwO35599 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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