Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms