Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms