Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarb2O35114 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms