Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcshO08795 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms