Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CltaO08585 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltaO08585 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltaO08585 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltaO08585 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CltaO08585 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CltaO08585 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltaO08585 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltaO08585 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltaO08585 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CltaO08585 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltaO08585 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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