Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C9

Vmn1r117, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r117L7N2C9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r117L7N2C9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r117L7N2C9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms