Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm8356J3QPD3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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