Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm17577J3QNF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17577J3QNF7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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