Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lipo1J3QME6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lipo1J3QME6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lipo1J3QME6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms