Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21818J3KMS6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21818J3KMS6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21818J3KMS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21818J3KMS6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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