Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r34G3XA52 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms