Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms