Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cald1E9QA15 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms