Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip11E9Q512 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms