Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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