Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acbd4E9Q289 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acbd4E9Q289 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms