Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms