Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gimd1E9PW74 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gimd1E9PW74 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms