Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms