Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl3E0CZ16 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms