Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim20D3Z7Q2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms