Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
3425401B19RikD3Z1D3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
3425401B19RikD3Z1D3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms