Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc8D3YZV8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc8D3YZV8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.1 ms