Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms