Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp27D3YV89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mmp27D3YV89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp27D3YV89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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