Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms