Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms