Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scn7aB1AYL1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms