Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2uB1AUC4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms