Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms