Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms