Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms