Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc3A6H6S0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc3A6H6S0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms