Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms