Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931406B18RikA2RSL7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931406B18RikA2RSL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms