Protein–RNA interactions for Protein: A2APT9

Klhdc7a, Kelch domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc7aA2APT9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhdc7aA2APT9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhdc7aA2APT9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms