Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem185aA2AF53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms