Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms