Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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