Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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