Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms