Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Upk3aQ9JKX8 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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