Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PtprtQ99M80 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprtQ99M80 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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